Założony w 1969 przez grupę włoskich komunistów, poszukujących swobody, jakiej nie dawały im partyjne media, Il Manifesto pozostaje gazetą niezależną, choć blisko związaną z włoską lewicą. Właśnie wsparcie sympatyków o lewicowych poglądach pozwoliło kilkakrotnie zażegnać poważny kryzys finansowy i uratować dziennik od bankructwa. W 1995 Il Manifesto, jako pierwsza włoska gazeta, uruchomił stronę internetową, na której można znaleźć część materiałów zamieszczonych w wersji papierowej oraz najważniejsze artykuły tygodnia.